Análisis del cambio en expresión génica durante el proceso de maduración de fruto entre una variedad cultivada y una silvestre de chile (Capsicum annuum L.).

Abstract

El chile (Capsicum annuum L.) es uno de los cultivos más importantes a nivel mundial. En Sonora, el chiltepín (Capsicum annuum L. var. glabriusculum) posee un papel sociocultural y económico importante, por lo que, ha llegado a convertirse en un fruto icónico de la región. Biológicamente, el chiltepín es de peculiar interés ya que es una variedad silvestre de Capsicum annuum que es la especie de chile con mayor distribución y producción mundial. El objetivo de este trabajo consistió en determinar los cambios cualitativos y cuantitativos en la expresión génica durante el proceso de maduración de fruto en dos variedades de chile: una domesticada (Capsicum annuum L; ‘Serrano Tampiqueño 74’), y su contra parte silvestre (Capsicum annuum L. var. glabriusculum; ‘Chiltepín’). Para ello se utilizaron herramientas bioinformáticas como Blast2GO, Hisat2, HTSeq, BLAST, las bases de datos KEGG y GO y el paquete estadístico R project. Se generaron estudios comparativos entre los transcriptomas de chiltepín a 20 y 68 días después de antesis (DDA) y de Serrano a 20 y 60 DDA, los cuales permitieron identificarlos genes con diferencias de expresión significativas, se categorizaron funcionalmente utilizando notación GO, KEGG y MapMan, y se identificaron genes relacionados con los procesos de maduración de fruto en tomate.